國家執業藥師資格考試科目分為:
藥學類:
藥事管理與法規(藥學類、中藥學類共考科目)
藥學專業知識(一)含藥劑學、藥物化學、藥理學、藥物分析
藥學專業知識(二)含臨牀藥物治療學、臨牀藥理學
中藥學類:
中藥學專業知識(一)含中藥學、中藥化學、中藥炮製學、中藥藥劑學、中藥藥理學、中藥鑑定學
中藥學專業知識(二)含臨牀中藥學、中成藥學和方劑學
中藥學綜合知識與技能
各科單獨考試,單獨計分,2016年執業藥師每科試卷滿分為120分。