每當一個人滿十歲的時候，就可以領取一隻神奇寶貝，簡稱寵物小精靈，他們是一種不可思議的生物，平常只要有他們，我們的生活就會更加美好。
這是一個剛滿十歲的小男孩，名叫小智，他收到了大木博士的邀請單，準備去大木博士的研究所拿寵物小精靈。
“小智，小智。”
小智媽媽清脆的聲音從樓下傳來。
小智聽到了媽媽的叫聲，連忙起來，説：“完了，今天是去拿寵物小精靈的日子，我不能遲到。”
於是，小智馬上穿好衣服，來到大木博士的研究所，發現沒人，於是就走出研究所，在旁邊的凳子上等着，這時，小智發現在遠處的.草叢裏，有着精靈的叫聲，小智很奇怪，於是就走了過去，這時，一隻皮卡丘跳了出來，對小智使出了電擊，眼看小智就要被擊中了，突然，一個寵物小精靈球飛來，將皮卡丘吸進裏面，關上了門，寵物小精靈球搖了幾下，便停下了。
“你好，小智。”一個聲音傳來。小智回頭一看，原來是大木博士。大木博士撿起地上的寵物小精靈球，帶着小智回到了研究所。“小智，很遺憾，小火龍，傑尼龜，妙蛙種子都被我孫子小茂拿走了。”
“什麼。”小智瞪大了眼睛，對大木博士説。
“不過沒關係，我這裏還有一隻剛捕捉來的皮卡丘，我就把它給你吧。”大木博士説完，把皮卡丘的寵物小精靈球，圖鑑和五個寵物小精靈球給了小智。
“這些都是你要弄到的，慢慢琢磨吧。”
“恩，我一定會努力的，我一定會成為寵物小精靈大師的。”小智説。
就這樣，小智與同伴皮卡丘踏上了旅程。
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